基因组转座子鉴别与注释方法研究进展

• 作者: 舒坤贤 蔡应繁 解增言 靳佩 黄飞飞
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 转座子 鉴别 注释 隐马尔柯夫模型 同源性 结构特征
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 3294-3296,3361
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 4144字
• 语种: 中文

摘要

转座子是一类可以在基因组不同位置间移动的、重复的序列,广泛存在于真核和原核生物基因组中,并对基因组的结构、功能和进化有着重要影响.转座子鉴别与注释是基因组注释工作的重要一步,相关软件可分为3类:从头算法、基于同源性的算法和联合算法,不同的软件实现方法和功能各不相同,并各有优缺点.文中对此进行了综述,并提出在今后的开发中将会出现更多结合多种算法的综合流程程序包,它们整合多种方法的优点,针对性强,可根据不同的需求来解决实际问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	舒坤贤	重庆邮电大学生物信息学院	64	491	10.0	21.0
2	蔡应繁	重庆邮电大学生物信息学院	31	198	7.0	12.0
3	解增言	重庆邮电大学生物信息学院	15	245	3.0	15.0
4	黄飞飞	重庆邮电大学生物信息学院	8	19	1.0	4.0
5	靳佩	重庆邮电大学计算机科学与技术学院	1	0	0.0	0.0