合作小型猪 T 细胞受体α链的基因结构及其多样性

• 作者: 冯海燕 房永祥 景志忠 曾爽 李玩生 杨孝朴 高建平
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 合作小型猪 TCRα基因 生物信息学 多样性
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 4701字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2014.06.001

摘要

目的：探讨猪TCR基因分子结构的复杂性及其与人类的相似性。方法以公开的猪TCRα链基因为参考序列设计两对特异性引物，用RT－PCR法从合作小型猪外周血、淋巴结和脾脏的淋巴细胞中克隆了93个猪TCRα基因（简称STA）。结果测序分析表明，克隆的猪TCRα链的基因均含有可变的信号肽区和V区、高变的J区和恒定的C区的基因片段，但基因间的核苷酸序列组成都不完全相同，且具有十分复杂的多态性和多样性，基因间的同源性在68．4％～98．7％，这与TCRα链的基本基因结构特征相一致。依据TCRα基因的同源性对其分子结构、遗传演化关系和归类分析发现，在其信号肽区、FR1区和CDR1区、FR2区和CDR2区以及FR3区和CDR3区都存在一些变异集中点和变异热点区。用IMGT／V－QUEST分析方法可将合作小型猪TCRαV区（ STAV）、J区（ STAJ）基因片段与人类的进行比较分析，发现合作小型猪TCRα与人类的遗传演化关系较近，每个序列都能找到与人类对应的TRAV、TRAJ基因片段，甚至V区的相似性可达92％以上。结论近交培育的合作小型猪在正常状态具有应对外界复杂微生物等环境的TCR遗传多样性分子基础，且适合作为人类免疫学及疾病研究的动物模型。