番茄DEAD-box RNA解旋酶基因SlDEAH1的克隆及表达分析

• 作者: 张建苓 朱明库 涂昀 胡功铃 胡宗利 陈国平
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 DEAD-box RNA解旋酶 SlDEAH1 胁迫 激素 RT-PCR分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 44-52
• 页数: 9页
• 分类号: Q81|S641.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2014.01.007

摘要

DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用.根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-box RNA解旋酶同源蛋白,命名为SIDEAH1,并根据其基因序列设计特异引物,应用RT-PCR方法从野生型番茄(Solanum lycopersicum) AC++中克隆得到了该基因的全长编码区序列.利用生物学网站、软件及实时荧光定量PCR方法,对其进行生物信息学、表达模式、胁迫及激素处理分析.结果表明:SlDEAH1包括2 073 bp的开放阅读框,编码690个氨基酸残基,其编码蛋白有9个保守结构基序,其所涉及到的ATP结合、ATP水解及RNA结合等功能对于解旋酶活性是至关重要的;表达模式分析表明SlDEAH1基因可能在野生型番茄萼片、叶片发育及果实成熟方面起到重要作用;高温、低温、脱水、伤害、盐胁迫不同程度的诱导了SlDEAH1的表达,但在根中该基因的表达受盐胁迫抑制;ABA、ACC、IAA、GA3、MeJA和ZT均不同程度诱导了SlDEAH1的表达,其中ABA诱导效应最为明显.这些结果为进一步研究SlDEAH1在番茄发育和胁迫响应中的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡宗利		53	641	12.0	24.0
2	陈国平		56	671	12.0	25.0
3	胡功铃		6	15	2.0	3.0
4	朱明库		7	90	2.0	7.0
5	涂昀		4	40	3.0	4.0
6	张建苓		2	0	0.0	0.0