小麦F-box家族基因的分类及克隆分析

• 作者: 于秀梅 刘大群 李铃仙 王逍冬 许媛 赵伟全 魏春茹
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 小麦 F-box家族基因 基因克隆 基因分类
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 页码范围: 22-28
• 页数: 7页
• 分类号: S512.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2016.0004

摘要

为明确小麦中F-box基因的存在种类及数量,作者通过数据库检索、编码区查找及功能结构域预测等途径,获得了NCBI和DFCI两大数据库中已报道的小麦F-box蛋白,并根据C端结构域特征对这些F-box蛋白进行了分类统计.数据库检索分类结果表明,在NCBI和DFCI数据库中共检索到符合条件的F-box基因38条,这些基因可以划分为F-box/LRR(17条,占总数的45％)、F-box/Kelch(6条,占总数的16％)和C端无明显结构域特征(15条,占总数的39％)3种类型.其中,F-box/LRR和C端无明显结构域类型所占比例较大.在此基础上,利用同源克隆策略在中国春小麦中获得了3条包含F-box结构域的序列,分别命名为Ta-SKP2A、Ta-FB和Ta-FBL14.Ta-SKP2A和Ta-FBL14属于F-box/LRR类型,Ta-FB仅包含一个F-box结构域,为C端无明显结构域类型.这些研究将为深入探讨F-box家族基因参与的小麦生物学过程及在其中的作用机理奠定基础.