龙须菜RSAP分析及其SCAR标记的转化

• 作者: 周伟 常连鹏 张淑 王津果 隋正红 马金华
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 龙须菜 RSAP 遗传多样性 栽培品系981 SCAR
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 47-53
• 页数: 7页
• 分类号: Q785
• 字数: 5299字
• 语种: 中文

摘要

初步探讨限制性位点扩增多态性(Restriction site amplified polymorphism,RSAP)分子标记技术在龙须菜遗传多样性检测和种质鉴定上的应用.利用所优化的适合于龙须菜RSAP分析的PCR反应体系,对青岛湛山湾野生群体和栽培品系981、07-2进行遗传多样性分析和比较.试验采用15对引物组合在3个群体14个龙须菜个体中共扩增出669个位点,其中多态位点数为146个,多态性比例22％,平均每对引物产生10条多态性条带,片段大小在100～1 000 bp之间.湛山湾野生群体的Na(1.007 5)、Ne(1.007 1)、H(0.003 6)、I(0.005 1)与栽培品系981的Na(1.003 0)、Ne(1.002 1)、H(0.001 2)、I(0.001 8),以及栽培品系07-2的Na(1.0090)、Ne(1.006 3)、H(0.003 7)、I(0.005 4)相比较可知3个群体的遗传多样性是有差异的.种群间的遗传多样性分析表明,在所有检测的样品中,遗传多样性多来自不同群体间的多样性.群体遗传结构分析表明,2个栽培品系981、07-2间遗传距离不大,但栽培品系与湛山湾野生群体间的遗传距离相对较大,而UPGMA聚类分析也明显的将湛山湾野生群体与栽培品系981、07-2区分开来,表明野生群体与栽培品系间已产生一定的遗传隔离.通过分析湛山湾野生群体及栽培品系981、07-2的RSAP指纹图谱,从中筛选栽培品系981的特异条带,并将其转化为稳定性好、特异性高的序列特征化扩增区(Sequence characterized amplified regions,SCAR)分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	隋正红	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	46	403	10.0	18.0
2	周伟	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	13	70	5.0	8.0
3	王津果	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	3	16	2.0	3.0
4	马金华	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	2	16	2.0	2.0
5	张淑	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	2	16	2.0	2.0
6	常连鹏	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	2	10	2.0	2.0