青海湖地区5株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列进化分析

• 作者: 刘琳玉 唐志坚 姜双应 徐翠玲 易虎 汪立杰 董婕 赵生仓 高荣保
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: H9N2 禽流感病毒 基因组 分子特征 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 109-118
• 页数: 10页
• 分类号: R373.1
• 语种: 中文

摘要

2012年7～9月从来源于青海湖地区活禽市场的环境样本中分离到5株H9N2亚型禽流感病毒,为了了解其基因遗传进化情况,本研究通过RT-PCR技术扩增分离毒株的8个基因片段,并进行全基因序列测定.对其分子特征及全基因序列进行遗传进化分析.结果显示5株病毒的HA基因片段的核苷酸相似度为93.2％～99.1％.NA基因核苷酸的相似度为94.5％～99.8％.A/environment/qinghai/017/2012的裂解位点为PSKSSRGLF,其它4个毒株的HA裂解位点均为PSRSSRGLF.5个病毒的HA基因第226位受体结合位点均为L.M1基因片段中发生了N30D和T215A替换.遗传进化分析表明5株病毒同2005年湖南分离的A/chicken/Hunan/5260/2005(H9N2)毒株类似,为一种重配基因型禽流感病毒.其中HA、NA、NS基因片段属于Y280-like支系,MP基因片段属于G1-like支系,NP、PB1、PB2、PA四个基因片段属于F98-like支系.