吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库的构建及差异基因分析

• 作者: 朱佳杰 李莉萍 王瑞 甘西 罗永巨 罗洪林 陈明
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 吉富罗非鱼 超雄鱼 消减文库 差异基因
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 1314-1320
• 页数: 7页
• 分类号: S965.125
• 字数: 4726字
• 语种: 中文

摘要

以吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼的血液为试验材料,采用抑制性消减杂交技术(SSH)构建YY超雄罗非鱼和XY雄鱼的消减文库.采用PCR方法评价文库的质量后,通过DNA测序技术对204个克隆进行测序,经手动去除载体和引物序列后获得86条Contig,应用BLASTX和BioGPS程序对所获Contigs进行生物信息学分析.成功构建了吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库,文库库容量(CFU)为3860,库重组率为95％,所获得的DNA片段集中分布在400～ 650 bp之间.获得31条罗非鱼序列,19条非罗非鱼序列,36条序列未发现同源蛋白,可能为YY罗非鱼的新基因.对罗非鱼种属的25条差异序列进行BioGPS功能分类分析发现这些序列参与12个生物过程,可将其分为至少8个不同的分子功能群.所获序列中编码磷酸甘油酰基转移酶-4样蛋白和N-(-乙酰转移酶-10 X2同种型的基因可能与罗非鱼的性发生发育相关.进一步分析发现血红蛋白、促红细胞生成素受体样蛋白、热休克蛋白、谷光氨肽样蛋白和锌指蛋白Gfi-1B样蛋白可能在YY超雄罗非鱼抗环境温度和应激方面发挥重要作用.所构建的吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库质量较高,适合YY超雄罗非鱼与XY雄鱼差异基因的筛选,为今后开发YY超雄罗非鱼性别鉴定方法奠定了坚实基础.