雏鸭肝炎病毒侵染下肝脏消减cDNA文库的构建及差异基因筛选

• 作者: 张扬 徐琪 李秀 段修军 毕瑜林 赵荣雪 陈国宏 陈昌义
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 雏鸭 雏鸭肝炎病毒 抑制性消减杂交 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 211-219
• 分类号: S834|S831.2
• 字数: 4079字
• 语种: 中文

摘要

本研究通过构建雏鸭肝脏消减cDNA文库,旨在筛选并鉴定与雏鸭病毒性肝炎相关的基因,对相关基因进行功能聚类分析进而探究其作用机理.利用抑制性消减杂交(Suppression subtraction hybridization,SSH)技术构建3日龄健康全同胞金定鸭人工感染雏鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)与同期注射等量生理盐水差异表达基因的SSH-cDNA文库.对其中563个阳性克隆进行测序,共获得299条差异表达序列标签(Expressedsequence tags,ESTs).去除冗余的cDNA序列载体并聚类拼接后,进行核酸和蛋白质同源性的比较和功能聚类分析.结果表明:有70个不同的基因与ESTs具有高度的同源性(E值＜e-10,匹配长度＞150 bp,匹配度＞80％),且多数基因与细胞组分合成、信号转导以及病理状态下的生物学调控过程相关.Ⅰ型雏鸭病毒性肝炎的发生和发展是多基因多步骤的复杂过程,该结果为深入研究雏鸭肝炎病的分子调控机制提供基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈国宏	扬州大学动物科学与技术学院	393	3876	28.0	46.0
2	徐琪	扬州大学动物科学与技术学院	178	1010	15.0	26.0
3	赵荣雪	扬州大学动物科学与技术学院	6	25	2.0	5.0
4	张扬	扬州大学动物科学与技术学院	59	219	7.0	13.0
5	陈昌义	江西农业大学动物科学技术学院	4	44	3.0	4.0
6	段修军		46	398	12.0	18.0
7	毕瑜林	扬州大学动物科学与技术学院	12	29	4.0	5.0
8	李秀	扬州大学动物科学与技术学院	6	44	4.0	6.0