上海市三株H9N2鸭禽流感病毒全基因遗传进化分析

• 作者: 刘健 周锦萍 杨德全 葛杰 葛菲菲 鞠厚斌
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: H9N2亚型禽流感病毒 遗传进化分析 遗传距离
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 页码范围: 15-20
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.5
• 字数: 3109字
• 语种: 中文

摘要

为了解上海市鸭群中H9N2亚型禽流感病毒（Avian influenza virus，AIV）的遗传变异特征，以及与疫苗株A/Chicken/Shan dong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998之间的遗传距离，对2007年和2009年分离自上海市鸭气管和泄殖腔样品采用荧光RT-PCR检测，将H9亚型禽流感病毒核酸阳性样品处理后，经鸡胚尿囊腔接种分离病毒，HI进一步确定血凝素( haemagglutin, HA）亚型，随后进行了全基因测序，并结合GenBank中的相关序列进行遗传进化分析。结果表明：3株分离毒株为H9N2亚型鸭禽流感病毒，HA蛋白裂解位点的氨基酸组成为PARSSRGLF，符合低致病性禽流感病毒特征，均属于经典的H9N2 Ck/Bei群系；NA基因均属于Y280系；NP、PA基因和A/Goose/Guangdong/1/1996（H5亚型）归为一群；PB2和M基因属于Qa/ HK/G1/97系；NS基因仍为Ck/Bei系；2007年的分离株和2009年的分离株在PB1基因上分属不同亚群。3株病毒的HA1基因与疫苗株A/Chicken/Shandong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998之间的遗传距离均大于7%。由此可见，3株鸭H9N2亚型毒株可能是由不同禽流感病毒基因亚群间发生自然重排的产物，现有疫苗对分离株的保护性需要进一步评估。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘健		52	184	7.0	11.0
2	周锦萍		89	317	10.0	13.0
3	鞠厚斌		64	242	9.0	12.0
4	杨德全		48	164	7.0	10.0
5	葛菲菲		53	203	8.0	12.0
6	葛杰		19	61	5.0	7.0