黑眉锦蛇的肝脏转录组分析

• 作者: 刘伟 赵尔宓 陈亮 陈克平
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑眉锦蛇 肝脏 solexa 转录组
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.6|Q78
• 字数: 4647字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7083.2014.01.001

摘要

黑眉锦蛇Elaphe taeniura广泛分布于东亚和东南亚,具有重要的生态学价值和经济学价值.蛇的肝脏是一个重要的代谢器官,具有重要研究价值,然而至今没有转录组数据信息.本研究应用Illumina Hiseq 2000测序仪对黑眉锦蛇肝脏cDNA进行转录组测序,分析其基因表达谱并进行功能分类.得到总reads 14 807 224对,平均读长长度为93 bp.进行de novo组装后,得到93 357个contigs,71 119个unigenes,共有88 907个contigs找到蛋白编码序列,共有26 134个预测蛋白可以在24种类别中注释其生物学功能.同时筛选到253个参与防御机制的蛋白.这些基因的发现为充实爬行动物基因组数据库提供了基础数据,同时也为蛇类资源保护、养殖以及药物开发利用提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵尔宓	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	20	116	7.0	9.0
5	陈亮	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	26	84	6.0	7.0
7	刘伟	西南民族大学生命科学与技术学院	39	57	4.0	5.0
8	陈克平	江苏大学生命科学研究院	102	716	13.0	21.0