AS-PCR检测TLR9基因SNP方法的建立及应用

• 作者: 张平安 童永清 舒颖 魏新素
• 来源期刊: 现代检验医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 等位基因特异性PCR Toll样受体9基因 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 分类号: Q503
• 字数: 3194字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7414.2014.02.004

摘要

目的 建立一种快速检测Toll样受体9(toll-like receptor 9,TLR9)基因rs187084和rs352140单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法,以及应用该方法检测湖北地区汉族人群各基因型的分布情况.方法 根据TLR9基因rs187084和rs352140 SNP中碱基变异频率分别设计野生型、突变型以及内参引物,建立等位基因特异性聚合酶链反应(allele specific PCR,AS PCR)检测135例体检人群外周血基因组DNA,以DNA测序法检测结果作为参照标准,并统计分析不同基因型在人群中的分布.结果 135例样本SNP位点均出现相应的野生型、突变型或者杂合子个体,AS-PCR的检测结果与DNA测序符合率为100％.湖北地区体检人群TILR9基因rs187084位点基因型为:CC型占8.14％(11/135),TT型占41.48％(56/135),CT型占50.37％(68/135).CC型所占比例最小(x2=82.21,P＜0.05),CT型比例略高于TT型,差异无统计学意义(x2=2.15,P＞0.05).TLR9基因rs352140位点基因型为:CC型占41.48％(56/135),TT型占11.11％(15/135),CT型占47.41％(64/135). TT基因型所占比例最小(x2=46.07,P＜0.05),CT型略高于CC型,差异无统计学意义(x2 =0.96,P＞0.05).结论 AS-PCR是一种简单、快速、可靠以及低成本检测TLR9基因SNP的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张平安	武汉大学人民医院检验科	186	1092	16.0	24.0
2	童永清	武汉大学人民医院检验科	63	194	7.0	10.0
3	舒颖	武汉大学人民医院检验科	13	31	3.0	4.0
4	魏新素	新疆生产建设兵团第一师医院呼吸血液科	8	21	3.0	4.0