江苏省2012年柯萨奇病毒B组<em>3</em>型分离株全基因序列分析

• 作者: 卞莲莲 叶强 姚昕 朱凤才 梁争论 毛群颖 王一平
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒B组3型(CVB3) 基因型
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 255-260
• 页数: 6页
• 分类号: R373.2+3
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨2012年江苏省手足口病(HFMD)患者临床样本中分离得到的3株柯萨奇病毒B组3型(CVB3)病毒的全基因序列特点.方法 采集江苏省东海县和邳州市2012年HFMD患儿的咽拭子或肛拭子样本16份,经Vero细胞分离培养得到3株CVB3病毒,利用RT-PCR扩增CVB3全长基因.利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析,构建系统进化树,并对CVB3的毒力位点进行比较.结果 扩增得到覆盖CVB3全基因组的3个片段,拼接后为CVB3全基因组,分别命名为DH09Y/JS/2012、DH16G/JS/2012和PZ23Y/JS/2012.同源性分析结果显示,该3株分离株之间同源性为87.6％～98.9％,与原型株(Nancy)的核苷酸同源性分别为80.5％、80.4％和81.2％.3个毒株均属于D2亚型.邳州市分离株和东海县2株毒株VP1区的同源性为91.8％～92.3％,分属于D2a和D2b两个不同分支.3株分离株除5'UTR的GUAA/GCAA模序和VP2的151位氨基酸外,其余毒力位点与近年引起心肌炎、无菌性脑膜炎等重症CVB3流行株一致.结论 引起2012年江苏省HFMD的CVB3为D2亚型,不同地区流行D2a和D2b两个分支,此次分离株主要毒力位点与近年来CVB3流行株一致.