随机游走模型识别蛋白质网络复合物算法

• 作者: 任远 林志杰
• 来源期刊: 上海电机学院学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质复合物 蛋白质网络 随机游走 GO本体
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 计算机技术
• 页码范围: 347-351
• 页数: 5页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 3787字
• 语种: 中文

摘要

识别出蛋白质复合物是理解蛋白质相互作用的重要方法。针对蛋白质网络中存在假阴性和假阳性问题，通过随机游走模型，有针对性对假阴性和假阳性数据进行有效筛选，定义 HP-complex图模型来识别具有生物意义的蛋白质复合物；利用GO本体计算蛋白质复合物之间的语义相似性，最终确定蛋白质复合物。实验证明，提出的基于随机游走模型的蛋白质复合物识别算法对输入参数不敏感，算法能够识别出有效的蛋白质复合物。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任远	上海电机学院电子信息学院	6	2	1.0	1.0
2	林志杰	上海电机学院电子信息学院	6	3	1.0	1.0