超氧化物歧化酶氨基酸网络与耐热性的关系研究

• 作者: 丁彦蕊 牟兆琳 王雪芹 蔡宇杰
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 工学
• 关键词: 氨基酸网络 网络参数 相互作用区域 热稳定性
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 146-156
• 页数: 11页
• 分类号: Q81|TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2014.40009

摘要

酶的热稳定性问题一直是生物科学领域的研究热点.构建氨基酸网络,从系统水平上研究酶热稳定性的影响因素是阐明嗜热酶耐热机制的重要途径.作者以超氧化物歧化酶(ironsuperoxide dismutase,Fe-SOD)的空间三维结构信息为基础,构建了不同类型的氨基酸相互作用网络.通过分析氨基酸网络的网络参数,发现热稳定性高的Fe-SOD氨基酸网络的平均度、平均连接强度及同配系数均高于常温的Fe-SOD氨基酸网络,而嗜热Fe-SOD氨基酸网络的特征路径长度小于常温的Fe-SOD氨基酸网络.此外,通过改变滑动窗口大小研究氨基酸网络中分子间相互作用区域范围,发现热稳定性高的Fe-SOD氨基酸网络中二级结构内部分子间连接紧密,二级结构之间及结构域之间的连接也较频繁.这些现象表明,嗜热Fe-SOD酶致密的内部结构缩短了氨基酸之间的距离,这更有利于稳定酶结构的作用力(如氢键和盐桥)的形成.实验结果进一步表明,通过研究氨基酸网络的网络参数可以阐述酶结构和功能之间的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡宇杰		126	785	14.0	20.0
2	丁彦蕊		51	266	9.0	14.0
3	王雪芹		2	0	0.0	0.0
4	牟兆琳		2	0	0.0	0.0