广州管圆线虫线粒体基因组比较分析

• 作者: 刘和香 吕山 周正斌 张仪 蒋明 郭云海 顾文彪
• 来源期刊: 中国血吸虫病防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 广州管圆线虫 线粒体基因组 比较分析
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 页码范围: 175-179
• 页数: 5页
• 分类号: R383.1+9
• 字数: 2575字
• 语种: 中文

摘要

目的：比较我国大陆地区广州管圆线虫线粒体基因组的多态性。方法在种群遗传学研究基础上，选取7条雌虫进行线粒体基因组的测定。根据广州管圆线虫线粒体基因组已知序列（GQ398121）设计12对引物，进行PCR扩增，并对目的片段进行测序和拼接。利用多种生物学软件对测定的线粒体基因组进行基因定位、结构图绘制、核苷酸及变异位点分析、进化关系分析。结果获得5个不同遗传类型的线粒体基因组。这些基因组的大小相似、结构相同，即13491～13502对碱基，含12个蛋白编码基因，2个核糖体基因，22个tRNA基因，2个较大的非编码区。上述基因紧密地排列在同一条DNA链上，并具有相同的转录方向。通过对这些基因组的比对发现，变异位点745个，占整个基因组的5.5%。其中，缺失/插入突变59个，碱基颠换105个，碱基转换581个。这些突变位点均匀地分布在整个线粒体基因组中。结论本研究提供了丰富的广州管圆线虫线粒体基因的突变位点，为构建种内鉴别诊断技术提供了基础。