甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因鉴别和表达模式

• 作者: 刘贵华 柳琼 王新发 陶章生 黄毅 黄邦全 黄顺谋
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 TFⅢA型锌指蛋白基因 基因结构 保守基序 表达模式
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 562-571
• 页数: 10页
• 分类号: S565.403
• 字数: 5577字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.05.002

摘要

植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、生化特性、进化关系和基因表达模式.结果表明:42个基因为单锌指蛋白基因,4个为多锌指蛋白基因;40个基因不含内含子,6个基因含内含子;46个基因的氨基酸序列同源性变幅为9.0％ ～99.2％,氨基酸序列保守性差异明显,亚类成员间包含相同的保守基序,亚类间的保守基序不同;PlantCARE分析发现其启动子区富含激素、非生物胁迫及特定生理过程响应的顺式作用元件;RNA-seq分析表明,部分基因在甘蓝型油菜品种中双11号的根、初花期雌蕊和角果中特异表达.