北极海洋链霉菌604F的卤化酶基因克隆及特征

• 作者: 廖丽 张晓华 陈波 陈瑞勤
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 卤化酶 放线菌 北极
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 703-712
• 分类号: Q814
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.06.014

摘要

[目的]本研究旨在克隆来自北极海洋、具有合成卤化物潜力的链霉菌(Streptomyces sp.)604F中的一个卤化酶基因,为后续克隆卤化物合成基因簇、分离鉴定卤化物提供指导.[方法]利用琼脂块法初步测试抗菌活性,借助液相色谱-飞行时间串联质谱技术(LC-Tof MS)初步寻找Streptomyces sp.604F发酵粗提液中的卤化物,并以简并PCR扩增合成次级代谢产物的指示基因(Ⅰ型、Ⅱ型聚酮合酶及非核糖体多肽合成酶编码基因);根据依赖黄素腺嘌呤二核苷酸的卤化酶基因保守区设计的简并引物,扩增基因片段并测序分析;采用高效热不对称交错PCR (hiTAIL-PCR)技术扩增卤化酶基因全长.[结果]Streptomyces sp.604F具有较强的抗白色念珠菌活性,其基因组同时含有编码Ⅰ型聚酮合酶、Ⅱ型聚酮合酶和非核糖体多肽合成酶基因,以及卤化酶基因;通过染色体步移克隆该卤化酶基因全长,共1443 bp,编码一个新的非色氨酸卤化酶,在合成已知卤化物的卤化酶数据库中,与其同源关系最近的为一类参与合成糖肽类次级代谢产物的卤化酶.[结论]Streptomyces sp.604F具有新的非色氨酸卤化酶,且推测参与糖肽类化合物的卤化修饰,为后续寻找目的卤化物提供了指导,也为研究该合成基因簇奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈波	华东理工大学生物工程学院	37	668	14.0	24.0
3	张晓华	中国海洋大学海洋生命学院	59	630	15.0	23.0
6	廖丽	中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室	4	13	2.0	3.0
7	陈瑞勤	华东理工大学生物工程学院	1	10	1.0	1.0