染色体微阵列分析技术分析22例先天性唇腭裂畸形患者

• 作者: 崔颖秋 张永玲 张颖 李茹 王洪涛 符芳 谢闺娥 雷婷缨 黎凡
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 关键词: 先天性唇腭裂 染色体微阵列分析 拷贝数变异 染色体微缺失 微重复
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 433-437
• 页数: 5页
• 字数: 4296字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2014.04.005

摘要

目的 应用染色体微阵列分析技术(chromosome microarray analysis,CMA)在全基因组水平分析先天性唇腭裂患者的遗传学病因.方法 选取先天性唇腭裂畸形患者22例(单纯性唇裂患者8例,单纯性腭裂患者4例,单纯性唇腭裂患者7例,唇腭裂合并先天性心脏病患者3例),常规G显带染色体核型分析均未发现异常.按照美国Affymetrix公司CytoScanTM HD芯片的标准操作流程对患者外周血DNA分别进行CMA检测,并通过配套的计算机软件及生物信息学分析结果.结果 全部22例患者均存在基因组DNA拷贝数变异(copy number variation,CNV),每例患者基因组含有2～9个100 kb到1.8 Mb不等的CNVs.在5例患者中检出高度可疑的致病性CNVs,占22.7％ (5/22).其中,单纯性腭裂患者可疑致病性CNVs的检出率为50％(2/4),单纯性唇腭裂患者检出率为14.3％(1/7),唇腭裂合并先天性心脏病患者检出率为66.7％(2/3).可疑致病性CNVs涉及的染色体片段分别为:8p23.1;10q22.2-q22.3;18q12.3;20p12.1以及6q26.其中,10q22.2-q22.3区域中的MYST4基因,20p12.1区域中的MACROD2基因以及8p23.1区域中的SOX7基因是新发现的先天性唇腭裂可疑致病基因.结论 CMA技术可以显著提高先天性唇腭裂遗传学病因的检出率,并且具有识别新的可疑致病基因的能力.对于常规G显带染色体核型分析未见异常的先天性唇腭裂患者,建议进一步行CMA技术分析.合并有其他先天性结构异常的唇腭裂患者,其基因组发生不平衡变异的风险显著增高.