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橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
作者:
何斌
唐朝荣
方永军
曹冰
梁启福
阳江华
龙翔宇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
橡胶树
HbF2KP
基因克隆
基因表达
生物信息学
摘要:
根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP.ORF Finder软件分析结果显示,该序列含有211 bp的5'端非编码区,173 bp的3'端非编码区,以及长度为2 244 bp的开放阅读框(ORF).氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的激酶和酯酶结构域,属于具有双功能的果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶.生物信息学分析显示,HbF2KP蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域且属于亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用.实时荧光定量PCR分析表明,HbF2KP基因在光合组织及非光合组织中均有表达.对非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式进行分析,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理及死皮胁迫调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与橡胶烃的生物合成调控及死皮胁迫应答.此外,HbF2KP表达受部分植物激素或激素类似物如乙烯利(ET)、植物生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控,但调控作用不明显.
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引文网络
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内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
来源期刊
南京林业大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
橡胶树
HbF2KP
基因克隆
基因表达
生物信息学
年,卷(期)
2014,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
23-28
页数
6页
分类号
Q78|S794.1
字数
6691字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2006.2014.04.005
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
唐朝荣
中国热带农业科学院橡胶研究所
41
253
8.0
14.0
2
龙翔宇
中国热带农业科学院橡胶研究所
20
62
5.0
6.0
3
方永军
中国热带农业科学院橡胶研究所
14
47
5.0
6.0
4
阳江华
中国热带农业科学院橡胶研究所
12
78
4.0
8.0
5
何斌
海南大学农学院
5
12
2.0
3.0
6
曹冰
海南大学农学院
6
17
3.0
3.0
7
梁启福
海南大学农学院
3
5
2.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(89)
共引文献
(53)
参考文献
(27)
节点文献
引证文献
(2)
同被引文献
(14)
二级引证文献
(1)
1975(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1980(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1981(1)
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1982(1)
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1986(1)
参考文献(1)
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1989(3)
参考文献(1)
二级参考文献(2)
1990(3)
参考文献(1)
二级参考文献(2)
1991(4)
参考文献(1)
二级参考文献(3)
1992(2)
参考文献(1)
二级参考文献(1)
1993(3)
参考文献(0)
二级参考文献(3)
1994(1)
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2013(2)
参考文献(2)
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2014(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2017(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2019(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2020(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
橡胶树
HbF2KP
基因克隆
基因表达
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
主办单位:
南京林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2006
CN:
32-1161/S
开本:
大16开
出版地:
南京市龙蟠路159号南京林业大学
邮发代号:
28-16
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
4299
总下载数(次)
8
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南京林业大学学报(自然科学版)1998
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第z1期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第6期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第5期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第4期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第3期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第2期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第1期
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