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摘要:
根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP.ORF Finder软件分析结果显示,该序列含有211 bp的5'端非编码区,173 bp的3'端非编码区,以及长度为2 244 bp的开放阅读框(ORF).氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的激酶和酯酶结构域,属于具有双功能的果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶.生物信息学分析显示,HbF2KP蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域且属于亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用.实时荧光定量PCR分析表明,HbF2KP基因在光合组织及非光合组织中均有表达.对非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式进行分析,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理及死皮胁迫调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与橡胶烃的生物合成调控及死皮胁迫应答.此外,HbF2KP表达受部分植物激素或激素类似物如乙烯利(ET)、植物生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控,但调控作用不明显.
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文献信息
篇名 橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
来源期刊 南京林业大学学报(自然科学版) 学科 农学
关键词 橡胶树 HbF2KP 基因克隆 基因表达 生物信息学
年,卷(期) 2014,(4) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 23-28
页数 6页 分类号 Q78|S794.1
字数 6691字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-2006.2014.04.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 唐朝荣 中国热带农业科学院橡胶研究所 41 253 8.0 14.0
2 龙翔宇 中国热带农业科学院橡胶研究所 20 62 5.0 6.0
3 方永军 中国热带农业科学院橡胶研究所 14 47 5.0 6.0
4 阳江华 中国热带农业科学院橡胶研究所 12 78 4.0 8.0
5 何斌 海南大学农学院 5 12 2.0 3.0
6 曹冰 海南大学农学院 6 17 3.0 3.0
7 梁启福 海南大学农学院 3 5 2.0 2.0
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HbF2KP
基因克隆
基因表达
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
双月刊
1000-2006
32-1161/S
大16开
南京市龙蟠路159号南京林业大学
28-16
1958
chi
出版文献量(篇)
4299
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8
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