铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株全基因组序列测定与分析

• 作者: 刘超 刘长庭 方向群 苏龙翔
• 来源期刊: 解放军医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 铜绿假单胞菌 基因组 测序 编码序列
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 738-740,758
• 页数: 4页
• 分类号: R378
• 字数: 2464字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-5227.2014.07.025

摘要

目的 全基因组测序和分析铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株,研究空间因素对细菌全基因组的影响,为宇航员的保健奠定基础.方法 通过革兰染色鉴定LCT-PA220属性,提取基因DNA、构建文库并上机测序;加工处理原始测序数据后进行基因组组装、注释和分析.结果 铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株革兰染色阴性,基因组为6.87M,包括5 829个编码序列,平均长度为962 bp,预测到为54个tRNA基因,COG数据库和KEGG数据库比对共注释到22组COG功能和32条KEGG信号通路.结论 铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株全基因组测序和基因组清楚,为后续对该菌株的研究打下了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘长庭	解放军总医院南楼呼吸科	200	1379	18.0	26.0
2	方向群	解放军总医院南楼呼吸科	53	327	9.0	15.0
3	刘超	解放军总医院南楼呼吸科	9	43	5.0	6.0
4	苏龙翔	解放军总医院南楼呼吸科	11	32	2.0	5.0