2012-2014年河南省猪流行性腹泻病毒M基因和ORF3基因的遗传变异分析

• 作者: 吴志明 周兵强 李宁 赵明军 赵雪丽 闫若潜 陈慧娟
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 M基因 ORF3基因 遗传变异分析
• 年，卷（期）: 2014,（12）
• 页码范围: 1236-1243
• 页数: 8页
• 分类号: S852.659.6
• 语种: 中文

摘要

为了解河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,对2012-2014年河南省不同猪场的150份腹泻样品进行了PEDV检测,并对其中14株PEDV的M基因和ORF3基因进行克隆测序和遗传进化分析.结果显示,这14个流行毒株M基因编码的氨基酸序列的同源性为96.9％～99.6％,与CV777经典毒株、韩国毒株及2010年以后国内流行的大多数毒株的氨基酸序列的同源性分别为97.4％～99.1％、96.9％～99.6％和97.8％～99.6％.这14个毒株中有2株ORF3基因与CV777疫苗株核苷酸序列的同源性为100％,存在49个核苷酸缺失;其余12株之间氨基酸序列的同源性为98.8％～100％,与CV777经典毒株、CV777疫苗株和韩国毒株氨基酸序列的同源性分别为95.1％～96.0％、90.2％～91.1％和97.3％～99.1％,与2010年以后国内流行的大多数毒株氨基酸序列的同源性为97.3％～99.6％.进化树分析显示,M基因可分为4个群,河南PEDV流行毒株主要以基因3群为主,其中CHHeN ZZ-2012毒株属于基因2群;ORF3基因分为3个群,CHHeN DF2-2012毒株和CHHeN ZZ-2012毒株分布于基因2群,其余12个毒株属于基因3群.结果表明,当前河南省主要流行的PEDV毒株M基因和ORF3基因与2010年以后国内流行的大多数毒株的同源性较高,与韩国毒株的亲缘关系较近;与经典毒株和疫苗株相比,其M基因和ORF3基因发生了变异,且临床出现或与疫苗株相似或与变异株相似的流行毒株.