基于线粒体及核DNA序列的河南烟草黑胫病菌群体遗传多样性分析

• 作者: 宋鹏宇 封松利 康业斌 李淑君 王海涛 蒋士君 邢国珍 郑文明
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草黑胫病菌 遗传多样性 系统进化 核基因 线粒体基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 16-22
• 分类号: S432.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2014.06.03

摘要

本研究选取2011年采自河南烟区的32个菌株,根据4个核基因(包括rDNA ITS、β-tubulin、Ras和Gpi基因)和1个线粒体基因(Cox1)的保守序列,克隆和测序分析160个相应的基因DNA片段.结果显示,这5个基因DNA序列在病菌群体内碱基序列与参照基因序列相比保守度在83％～100％不等,平均基因型多样性指数(M)为1.422 7.综合使用5个基因联合序列联合构建群体进化系统树,揭示了分布于河南省14个县区的32个分离菌系可分为2个明显的组,包括15个不同的联合基因型,基因型多样性指数为2.35,反映了病菌致病变种内存在的遗传变异多样性.其中,最优势的2个联合基因型分别涵盖8个c基因型菌系和6个e基因型菌系.然而,各基因型间遗传分化的总水平很低,组间的遗传距离仅为0.000 5,说明烟草黑胫病菌在河南生长烟草中的菌株可能属于同一有效群体.同时,不同分化菌株遗传亲缘关系与地理来源之间也没有显著的相关性,表明烟草黑胫病菌河南群体内存在密切的菌源交流,没有形成明显的地理亚群体分化.本研究结果可广泛应用于大规模黑胫病菌群体菌系的动态检测,服务于烟草抗黑胫病育种和品种合理布局.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋士君	河南农业大学植物保护学院	44	448	12.0	19.0
2	康业斌	河南科技大学林学院	61	370	10.0	16.0
3	郑文明	河南农业大学生命科学学院	23	228	7.0	14.0
4	王海涛	河南省烟草公司烟草研究所	6	32	3.0	5.0
5	李淑君	河南省烟草公司烟草研究所	4	19	3.0	4.0
6	邢国珍	河南农业大学生命科学学院	12	16	3.0	3.0
7	封松利	河南农业大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0
8	宋鹏宇	河南农业大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0