基于线粒体COII基因序列的长江下游翘嘴群体遗传多样性分析

• 作者: 张桂宁 方弟安 薛向平 毛成诚 彭云鑫
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 翘嘴鲌 COII基因 遗传多样性 遗传分化 长江下游水域
• 年，卷（期）: 2023,（7）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 2025-2032
• 页数: 7页
• 分类号: S965.123
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.07.026

摘要

【目的】明确长江下游翘嘴鲌（Culter alburnus）群体遗传多样性的丰富程度和进化历史，为其育种及遗传改良打下基础。【方法】在长江下游水域（淀山湖、高邮湖、太湖、长荡湖及长江江苏段）设点捕获收集翘嘴鲌野生样本，基于线粒体COII基因序列分析5个翘嘴鲌野生群体的遗传多样性，使用DNASPv5计算群体单倍型并进行Tajima's D和Fu's Fs中性检验，运用Arlequin 3.5进行遗传多样性分析、群体分子方差分析（AMOVA）及计算遗传距离和基因流（Nm）。【结果】5个翘嘴鲌野生群体197个个体的COII基因序列有效长度为425 bp，存在31个变异位点，变异率为7.29%；其碱基含量排序为T（29.61%）>C（28.03%）>A（24.19%）>G（18.17%），AT含量为53.8%，CG含量为46.2%。31个变异位点在197个个体中共定义出13种单倍型（hap1~hap13），单倍型多样性指数（Hd）为0.273~0.603，以长江群体和长荡湖群体的最高，太湖群体的最低；核苷酸多样性指数（Pi）为0.001~0.017，以长荡湖群体的最高，淀山湖群体的最低。5个翘嘴鲌野生群体间的遗传距离为0.002~0.015，即群体间无显著差异；不同群体间的Nm为2.443~54.325，以太湖群体与淀山湖群体间的Nm最大（54.325），长荡湖群体与淀山湖群体间的Nm最小（2.443）；AMOVA分析结果显示，不同群体间的遗传变异为10.47%，而群体内的遗传变异为89.53%。在5个翘嘴鲌野生群体中，仅长江群体的Tajima's D和Fu' Fs均为负值且具有显著意义，故推测该群体曾发生过群体扩张现象。【结论】长江下游翘嘴鲌群体表现出低单倍型多样性和高核苷酸多样性，遗传多样性较丰富，群体间存在遗传分化但分化程度差异不显著。因此，后续研究应增加野生翘嘴鲌群体的样品数量和调查水域，全面而系统地评估长江下游各水域翘嘴鲌的种质资源状况，为建立自然保护区及人工增殖放流提供科学依据。