基于线粒体COII-LrRNA基因对肾形肾状线虫种内群体的遗传多样性分析

• 作者: 田忠玲 邓艳凤 郑经武
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 肾形肾状线虫 线粒体DNA(mtDNA) COII-LrRNA基因 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 593-599
• 分类号: Q933
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2016.04.014

摘要

肾形肾状线虫(Rotylenchulus reniformis)是一种植物半内寄生线虫,分布于世界的热带和亚热带地区,是许多蔬菜和热带果树重要的病原线虫.为明确该线虫种内群体的遗传变异,本研究采用序列分析法,对采自浙江(ZJ)、福建(FJ)和重庆(CQ)3个地区的肾形肾状线虫的线粒体COII-LrRNA基因序列进行比较.结果表明,肾形肾状线虫线粒体COII-LrRNA基因片段序列为557～563 bp,AT含量为85.5％,明显高于GC含量.序列分析所得3个群体总的变异位点数、单倍型数、单倍型多样性指数(haplotype diversity,Hd)和核苷酸多样性指数(nucleotide diversity,π)分别为176、40、0.946和0.157 4.分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)结果显示,这3个肾形肾状线虫群体间遗传分化系数为0.058 15,遗传分化程度中等,没有明显的地理隔离.遗传变异结果显示,94.18％的变异来自群体内个体间,只有5.82％的变异发生在群体间.结果说明,我国肾形肾状线虫种群内COII-LrRNA基因序列变异较明显,具有丰富的遗传多样性,且对环境变化的适应能力较强.研究结果丰富了我国肾形肾状线虫的系统发育信息,为肾形肾状线虫危害植物的内在遗传因素的研究提供了资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑经武	浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所	40	468	11.0	20.0
2	邓艳凤	浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所	3	4	1.0	1.0
4	田忠玲	浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所	8	25	3.0	4.0