分枝杆菌噬菌体Leo的生物学和基因组学特征

• 作者: 刘平 江莉莎 邬亭亭 郭述良
• 来源期刊: 华中科技大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 分枝杆菌噬菌体Leo 基因组 结核分枝杆菌
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 506-511
• 页数: 6页
• 分类号: R52
• 字数: 3550字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-0741.2014.05.004

摘要

目的 筛选能有效裂解结核分枝杆菌的噬菌体,并了解其生物学和遗传学信息.方法 双层平板法扩增噬菌体,观察噬菌斑形态;电镜观察噬菌体颗粒形态;单斑法检测噬菌体宿主谱.采用λ噬菌体提取试剂盒提取噬菌体DNA,鸟枪法测序,得到的DNA序列用Phred/PhraD/Consedh软件包组装,拼接重叠群,PCR扩增重叠群缺口.采用DNAStar软件包、Glimmer3.0基因预测软件、Promoter prediction/Prokaryotic程序进行基因成分分析,基因功能预测,启动子区预测,并同时对Leo作共线性分析及构建系统进化树.结果 噬菌体Leo由多面体头部和尾部构成,头部直径(70.0±3.0)nm,尾长(211.0±31.7)nm.其噬菌斑清晰透明,能裂解不同的结核分枝杆菌临床分离株.Leo基因组全长39 981 bp,GC含量66.86％,含3个可能的启动子区,不含串联重复序列和tRNA区.Leo含59个基因,gene32编码整合酶,不含编码阻遏蛋白的基因和不利基因,Leo与BPs和Angel相似性最高.结论 噬菌体Leo是一株不含不利基因的裂解性噬菌体,能裂解结核分枝杆菌,可以作为鸡尾酒疗法的候选噬菌体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭述良	重庆医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科	140	565	14.0	17.0
2	邬亭亭	成都市第三人民医院呼吸内科	13	43	4.0	6.0
3	江莉莎	重庆医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科	10	28	4.0	5.0
4	刘平	重庆市长寿区人民医院呼吸内科	10	12	3.0	3.0