基于多重集逆序数的DNA序列的数值刻画及其应用

• 作者: 张盈盈 李春 杨闫 贾美多
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: 多重集 逆序数 系统发生分析
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 705-708
• 页数: 4页
• 分类号: TQ015.9|TP391.9|O6-39
• 字数: 3178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11719/com.app.chem20140614

摘要

随着人类和其它一些模式生物基因组计划的实施与完成,DNA序列的数量呈指数方式增长,这使得序列分析成为生物信息学的核心问题之一.众所周知,序列之所以称为“序列”,自然而然地包含了2个重要因素:元素及其之间的序关系.本文介绍一种全新的考虑元素之间序关系的方法,首先将传统集合上的排列的逆序数推广到多重集上,从而提出带有重复元素的排列的逆序数的概念;在此基础上通过将数字1、2、3、4分别赋值给4个碱基,将DNA原始序列转化为多重集上的数字排列,进而借助逆序数构造出DNA序列的24维向量表示;基于3个数据集的系统发生分析,证实了该方法的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李春	渤海大学数理学院	25	82	5.0	8.0
2	杨闫	渤海大学数理学院	4	4	2.0	2.0
3	贾美多	渤海大学数理学院	3	4	2.0	2.0
4	张盈盈	渤海大学数理学院	2	4	2.0	2.0