ACOT1蛋白突变的分子动力学研究

• 作者: 周家蓬 张丽杰 李昊阳 李雪楠 陈禹保
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: ACOT1 ACOT1_MULT 序列突变 氢键 疏水相互作用 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 727-731
• 页数: 5页
• 分类号: O641
• 字数: 3943字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11719/com.app.chem20140619

摘要

酰基辅酶硫醣酶(Acyl-CoA thioesterases,ACOTs),也被称作酰基辅酶A水解酶,是一类能够水解酰基辅酶A酯类水解的酶,在脂肪酸的代谢中起着重要的作用.文中通过将序列分析得到的ACOT1的有害突变序列(ACOTl _MULT)和野生型序列利用同源建模的方法得到了相应的蛋白结构,并利用分子动力学模拟的方法研究了突变氨基酸对蛋白结构造成的影响.研究结果发现:突变蛋白在分子动力学过程中活性中心上面的“盖子”(LEU374-SER380)区域打开,而野生型一直处于关闭状态.通过对氢键和疏水作用的分析发现,突变位置的氨基酸(ALA189THR)与蛋白序列中的GLY169形成了新的氢键,突变残基附近的氢键也发生了很大的变化,导致了α/β水解酶区域的第3个β折叠的末端Loop区(160Loop)朝着外侧的亲水性区域拉伸.160Loop区域的变化使得它与“盖子”区域之间的疏水相互作用消失,“盖子”区域的稳定性下降,并最终导致了“盖子”的打开.该结果对ACOT1蛋白相关的人类免疫病毒缺陷疾病和附睾炎等疾病的发病机理的研究具有很好的借鉴作用,同时也为基于该活性区域的抑制剂筛选工作提供了新的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈禹保		14	50	3.0	6.0
2	张丽杰		3	18	2.0	3.0
3	李雪楠		1	1	1.0	1.0
4	李昊阳		1	1	1.0	1.0
5	周家蓬		5	33	2.0	5.0