Soat1基因的e-QTL定位和遗传调控网络分析

• 作者: 张玉芳 李奕 林巍巍 王晓冬 陆璐 陈雪 陈颖
• 来源期刊: 江苏医药
• 学科: 医学
• 关键词: 甾醇氧-酰基转移酶1 基因表达数量性状基因座 遗传调控网络
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 135-137,封3
• 分类号: R394
• 语种: 中文

摘要

目的 从全基因组水平研究甾醇氧-酰基转移酶1 (Soat1)介导的阿尔兹海默病(AD)发病的分子机制.方法 运用基因表达数量性状基因座(eQTL)定位方法对Soat1基因的表达变异及表达调控进行研究,采用区间作图在全基因组水平定位控制Soat1基因表达变化的eQTL.分析B6小鼠和D2小鼠两品系间的单核苷酸多态性对eQTL定位的影响.采用聚类分析筛选BXD重组近交系小鼠海马组织基因组中受Soat1基因反式调节的候选基因,通过Pearson相关系数法构建Soat1基因的表达遗传调控网络.结果 Soat1基因为顺式作用的eQTL,Rab2、Taz、copg、whsc1l1、Atrnl1、1200008A14Rik和Epdr1为该基因的下游候选调控基因.与Soat1基因高度相关的前17个基因构建遗传相关基因网络.结论 Soat1基因为顺式调控基因;遗传相关基因网络中的基因与Soat1基因存在相互作用,直接或间接参与了AD的发病.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王晓冬	南通大学组织学与胚胎学系	75	191	7.0	9.0
2	林巍巍	南通大学组织学与胚胎学系	19	40	4.0	5.0
3	陈雪	南通大学组织学与胚胎学系	26	62	5.0	6.0
4	李奕	南通大学组织学与胚胎学系	19	51	5.0	6.0
5	陈颖	南通大学组织学与胚胎学系	38	48	5.0	6.0
6	张玉芳	南通大学组织学与胚胎学系	5	1	1.0	1.0
7	陆璐	南通大学组织学与胚胎学系	5	1	1.0	1.0