黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析

• 作者: 屈会娟 张敏 张聪 曾绍华 李明 蒲志刚 阎文昭
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫薯 黑斑病菌诱导 抑制差减杂交技术 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 53-58
• 页数: 6页
• 分类号: S435.311
• 字数: 5360字
• 语种: 中文

摘要

本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经罴斑病菌诱导12、24、36、48、60h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库.随机挑取103个cDNA克隆进行5端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ES-Ts,利用tblastx对87个序列在NCBI数据库中进行同源性比对.结果表明,在编号为14的EST中找到了“蔷薇”黑斑抗性muRdr1基因位点,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr 1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1共9个基因.另外有2类基因的含量较高,一类是紫薯组织特异性相关基因,另一类是紫薯受干旱胁迫的抗逆相关基因.构建cDNA文库,应用EST技术并结合生物信息学技术,对紫薯抗病相关基因的表达分析,从基因水平上来研究紫薯抗病机制,为今后的紫薯抗病遗传育种及抗病机理奠定论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张敏		139	1396	19.0	27.0
2	蒲志刚	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	37	398	10.0	19.0
3	阎文昭	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	42	371	11.0	17.0
4	张聪	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	9	22	4.0	4.0
5	李明	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	19	64	4.0	7.0
6	屈会娟	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	47	188	7.0	12.0
7	曾绍华		1	0	0.0	0.0