甘薯茎线虫诱导抑制差减杂交cDNA文库的构建及表达序列标签分析

• 作者: 刘庆昌 商丽丽 翟红
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 甘薯 茎线虫 抑制差减杂交 表达序列标签 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 研究资源
• 页码范围: 141-148
• 页数: 8页
• 字数: 5274字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.01.022

摘要

以甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)抗茎线虫病品种鲁薯3号为材料,利用抑制差减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,构建了甘薯茎线虫诱导的甘薯块根cDNA文库.从中筛选出1379个阳性克隆进行测序,用CAP3软件聚类拼接,得到185个unique EST.Blast2Go比对ESTs,并进行GO功能分类,结果发现151条非重复序列与已知基因同源性很高,占全部非重复序列的81.6%.已知功能的EST涉及植物的能量代谢、信号转导、抗病防卫、蛋白质合成等多方面.通过对已知功能的基因进行分析,推测促分裂原活化蛋白激酶、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、过氧化氢酶、几丁质酶、葡聚糖酶等可能参与甘薯接种茎线虫后相关的抗性反应.实时荧光定量PCR分析结果表明,与抗茎线虫病相关的4个基因在甘薯接种线虫后不同时间点具有不同的表达模式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	翟红		2	18	2.0	2.0
2	刘庆昌		2	18	2.0	2.0
3	商丽丽		1	9	1.0	1.0