茄子SmWRKY1转录因子基因克隆及序列分析

• 作者: 徐岭贤 赵福宽 邵帅
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 茄子 WRKY1 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 124-128
• 分类号: S641.1
• 语种: 中文

摘要

克隆茄子转录因子SmWRKY1基因,对其序列进行分析,为SmWRKY1基因在茄子抗逆分子育种的应用中提供理论依据.以茄子幼苗为试材,依据GenBank上已提交的番茄、甜椒、烟草的WRKY基因序列设计引物,提取总RNA利用RT-PCR方法扩增得到基因片段,克隆、测序并通过NCBI在线和DNAMAN等软件对其核酸及氨基酸序列进行分析.同源克隆得到SmWRKY1,核酸序列930 bp,翻译为310个氨基酸组成的蛋白序列,其中Ser和Thr量最多,分别占总氨基酸数的12.0％和11.0％.NCBI检索SmWRKY1属于WRKY基因超家族,第114至120个氨基酸含有WRKY保守结构域“WRKYGQK”,其锌指结构为C2H2型,初步证实SmWRKY1属于第二大类WRKY转录因子.DNAMAN构建茄子SmWRKY1与不同植物WRKY蛋白的系统发育树,表明茄子WRKY1与番茄中的WRKY1蛋白亲缘关系最近,同源性达96％.WRKY基因在植物耐逆性的研究中有着重要的作用,通过克隆出SmWRKY1基因片段,为进一步克隆其全长、研究其功能做前期准备,为分子育种、培育茄子耐逆性新品种奠定了一定的基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵福宽	北京农学院生物科学与工程学院	60	472	13.0	18.0
2	邵帅	北京农学院生物科学与工程学院	2	12	2.0	2.0
3	徐岭贤	北京农学院生物科学与工程学院	3	16	3.0	3.0