基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析

• 作者: 刘平 孙学宏 张成 杜勇 马玉韬
• 来源期刊: 湖北农业科学
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质编码区预测 窄通带滤波器 归一化的功率谱密度值 信噪比 近似相关系数
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1432-1435
• 页数: 4页
• 分类号: TP391.9|TN713
• 字数: 2480字
• 语种: 中文

摘要

蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视.研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR (Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较.结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜勇	宁夏医科大学总医院小儿外科	28	70	5.0	6.0