基于GSN稳转肝癌细胞的转录组新基因研究

• 作者: 何敏 刘丽敏 周怡 李刚 李洪涛 臧宁 邓小芳
• 来源期刊: 医学信息
• 关键词: GSN SMMC7721 慢病毒载体 转录组 新基因
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 临床医学 -- 论著
• 页码范围: 53-54
• 页数: 2页
• 字数: 2803字
• 语种: 中文

摘要

目的：凝溶胶蛋白(Gelsolin, GSN)是凝溶胶蛋白超家族的成员之一，被发现对肿瘤转移具有促进作用。本研究旨在构建 GSN双标签慢病毒载体，发现 GSN过表达肝癌SMMC7721细胞转录组新基因。方法 PCR扩增GSN cds全长片段，接入带FLAG-HA双重标签的PCDH-CMV-MCS-EFl-Puro慢病毒载体中，经测序鉴定的重组质粒，病毒包装后转染人肝癌细胞SMMC7721，嘌呤霉素筛选稳定表达细胞系；In-Cel Western(ICW)检测 GSN在 SMMC7721肝癌细胞中的表达，Ion proton测序系统对转染及未转染的肝癌细胞进行mRNA测序。结果测序表明重组质粒DNA序列与NCBI检索到的GSN编码序列一致；ICW检测到稳定转染细胞中GSN蛋白的表达为未处理细胞的2.02倍（P<0.05）；转录组测序共发现差异表达新基因21个，其中上调表达基因12个，下调表达基因9个，6个基因上调和4个基因下调的绝对表达值倍数变化均>4。结论基于GSN稳定表达的SMMC7721肝癌细胞株所发现的转录新基因，为研究 GSN在肝癌中的作用机制开拓新方向。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何敏	广西医科大学公共卫生学院	115	586	12.0	17.0
5	李刚	广西医科大学医学科学实验中心	28	115	8.0	10.0
6	邓小芳	广西医科大学公共卫生学院	1	0	0.0	0.0
7	周怡	广西医科大学医学科学实验中心	28	96	5.0	7.0
8	李洪涛	广西医科大学医学科学实验中心	14	49	5.0	6.0
9	臧宁	广西医科大学医学科学实验中心	24	54	4.0	6.0