基于随机游走的蛋白质功能预测算法设计与实现

• 作者: 张军杰 贾翠翠 马吉权
• 来源期刊: 黑龙江大学工程学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质功能预测 蛋白质-蛋白质相互作用网络 随机游走 蛋白质功能注释 K近邻 多标签分类
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 电子工程与计算机科学
• 页码范围: 73-78
• 页数: 6页
• 分类号: TP311.13
• 字数: 4376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13524/j.2095-008x.2015.03.050

摘要

在构建蛋白质相互作用网络时从通路数据出发，利用通路数据整合蛋白质相互作用网络。提出了一个基于随机游走的蛋白质功能预测方法，在该算法中把已知功能的蛋白质当作起始点，对于随机游走在蛋白质互作网络中产生的邻居信息，转换为注释模式信息，并根据已知功能的蛋白质的功能来提取未知功能蛋白质的注释模式。利用传统的 K近邻算法从训练样本集中找到未知功能蛋白质的k个最近邻。最后，结合多标签分类的K近邻算法，统计 k个近邻中蛋白质的功能类数目，基于最大后验概率预测未知功能蛋白质属于的功能标签类。通过在构建蛋白质互作网络进行实验，结果表明提出的方案能够有效地进行蛋白质功能预测。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马吉权	黑龙江大学计算机科学技术学院	11	65	5.0	7.0
2	贾翠翠	黑龙江大学计算机科学技术学院	1	5	1.0	1.0
3	张军杰		1	5	1.0	1.0