云南哈尼梯田当前栽培水稻遗传多样性及群体结构分析

• 作者: 刘巧泉 刘承晨 吴晓霞 张昌泉 徐小颖 朱孔志 武建勇 薛达元 赵富伟 金银根 黄绍文
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 哈尼梯田 SSR 标记 遗传多样性 群体结构
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 28-34
• 页数: 7页
• 分类号: Q755|S511?021
• 字数: 5110字
• 语种: 中文

摘要

利用118对 SSR 分子标记对2012年云南哈尼梯田的47份水稻材料进行多态性检测,分析其遗传多样性,并利用Structure 2．3．4软件进行群体结构分析.结果显示,118对 SSR 标记共检测到255个等位变异,变幅为2~4个,平均每个标记2．161个.基因多样性指数变异范围为0．043~0．656,平均0．303.多态信息含量(PIC)变异范围为0．042~0．583,平均0?256.其中高度多态位点(PIC＞0．5)有2个,中度多态位点(0．25＜PIC＜0．5)有66个；通过遗传相似系数及基于数学模型的群体结构分析均将供试材料分为偏籼和偏粳2个类群；聚类结果和海拔高度总体上没有明显规律,但偏籼类群中的偏籼红米亚群按海拔高低分别聚在一起.研究表明,云南哈尼梯田现有栽培水稻以偏籼水稻为主,但本研究估测的遗传多样性低于前人报道.