云南哈尼梯田当前栽培水稻ALK基因的遗传多样性及与稻米糊化温度的关联分析

• 作者: 李闯 刘承晨 张昌泉 朱霁晖 徐小颖 赵福伟 黄绍文 金银根 刘巧泉
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 水稻 ALK基因 遗传多样性 哈尼梯田 糊化温度
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 343-353
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.00343

摘要

云南是世界公认的亚洲栽培稻遗传多样性和起源中心之一。利用51对SSR分子标记对云南哈尼梯田当前栽培的111份水稻材料进行多态性检测，并分析其群体结构。聚类分析表明，供试材料主要分为偏粳类群(groupI)及偏籼类群(groupII)两大类群，其中以偏籼类群居多，占83%，这两类群并未完全按地理来源聚类。所选材料稻米的糊化温度变异较广，可以分为低(<66℃)、中低(66~70℃)、中高(70~74℃)和高(>74℃)4类。通过基因测序，分析了稻米糊化温度控制基因ALK的序列多样性，发现其可以分为10种单倍型。关联分析结果表明，所选水稻样品稻米的糊化温度主要由ALK基因3个SNP位点组合控制。其中，A-GC和G-TT两种组合主要控制低(<66℃)和中低(66~70℃)糊化温度，G-GC组合主要控制中高(70~74℃)和高(>74℃)糊化温度。SNP3402T类型与高、中高糊化温度有关。绝大多数偏籼类品种的ALK基因含有G-GC组合，因此都倾向于高糊化温度。上述研究结果为水稻分子育种和种质资源保护研究提供了一定的参考价值。