2013年杭州地区肠道病毒71型分离株VP1基因特征分析

• 作者: 吴亦栋 宋闻 林先耀 王娟 蒋茂莹 赵仕勇
• 来源期刊: 国际流行病学传染病学杂志
• 关键词: 肠道病毒感染 VP1基因 序列分析 点突变
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 80-85
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4149.2015.02.003

摘要

目的 了解2013年杭州地区重症手足口病患儿感染的肠道病毒71型(EV71)分离株VP1区的基因特征.方法 采集2013年杭州市儿童医院收治的重症手足口病确诊病例粪便样本,用EV71特异性引物进行RT-PCR鉴定,选取EV71检测阳性的15例样本进行病毒分离并进行VP1基因的特异性扩增并测序,结合EV71各基因型及亚型的代表株构建系统进化树,并对VP1蛋白的氨基酸序列进行分析.结果 2013年该院分离的15株EV71分离株与A、B基因型参考株的核苷酸同源性分别为77.5％～79.8％、77.7％～83.1％,氨基酸同源性分别为92.8％～96.6％、92.8％～97.9％,与C基因型的核苷酸同源性为83.4％～97.3％,氨基酸同源性为93.4％～99.7％,其中与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株[C4a (Fuyang-0508)]的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为95.0％～97.3％及96.2％～99.7％.系统进化树显示所有分离株与C4a亚型的代表株处于同一分支.15株EV71分离株与不同基因型代表株进行比对发现,在297个氨基酸位点中主要突变位点有11个.结论 2013年杭州地区重症手足口病患儿中流行的EV71均为C4a基因型,其VP1基因保守性好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴亦栋	杭州市儿童医院感染科	49	239	9.0	13.0
2	蒋茂莹	杭州市儿童医院感染科	14	78	5.0	8.0
3	赵仕勇	杭州市儿童医院感染科	57	270	11.0	14.0
4	王娟	杭州市儿童医院感染科	10	11	2.0	3.0
5	林先耀	杭州市儿童医院感染科	29	102	5.0	9.0
6	宋闻	杭州市儿童医院感染科	21	118	5.0	10.0