水茄泛素结合酶E2基因StUBCc的克隆及黄萎病菌诱导表达分析

• 作者: 刘富中 刘炎霖 张映 连勇 陈钰辉
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水茄 StUBCc 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1185-1194
• 分类号: S641.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0151

摘要

以茄子近缘野生种水茄(Solanum torvum Swartz)幼苗根部为试材,并以黄萎病菌(大丽轮枝菌,Verticillium dahliae Kleb)处理的水茄的抑制差减文库中差异表达的EST片段F290为基础,利用RACE技术,获得一个756 bp的cDNA全长序列.经生物信息学分析发现该序列为泛素结合酶E2-2(UBC2)载体蛋白同源基因,命名为StUBC,GenBank登录号为KP330492.StUBCc基因编码区共459bp,编码152个氨基酸,该蛋白分子量为63.0925kD,等电点为5.13.采用MEGA5软件对StUBCc和其他同源蛋白的氨基酸序列比对,结果表明其与葡萄的同源蛋白一致性最高,达99％,有很高的功能区段保守性.采用荧光定量PCR对黄萎病菌侵染不同时间的水茄幼苗根部StUBCc基因的表达量进行测定,发现在侵染6h后,表达量最高,为对照(无菌水处理)的6.79倍.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	连勇	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	65	1276	22.0	33.0
2	刘富中	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	58	1113	20.0	32.0
3	陈钰辉	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	45	744	17.0	26.0
4	张映	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	27	234	10.0	14.0
5	刘炎霖	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	1	15	1.0	1.0