结核分枝杆菌Rv3134c蛋白抗原表位的预测

• 作者: 吴雪琼 崔瑞娜 张俊仙 梁艳 白雪娟 赵卫国 阳幼荣
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 Rv3134c蛋白 抗原表位 二级结构 预测
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 541-546
• 页数: 6页
• 分类号: R378.91
• 字数: 3639字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2015.06.010

摘要

目的 预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位,最后BLAST分析其与人类抗原表位的同源性.结果 Rv3134c蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有较多潜在的B细胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184 195、209-216、233-238位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高.该蛋白潜在的T细胞抗原表位较少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248 255位氨基酸残基或其附近.BLAST分析结果显示,其与人类抗原表位的同源性很低.结论 结核分枝杆菌Rv3134c是一个即含有较多B细胞抗原表位又含有较多T细胞抗原表位的蛋白抗原,实验结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与合成肽疫苗奠定了基础.