牦牛Ihh基因组织表达分析、SNP检测及其基因型组合与生产性状的关联分析

• 作者: 李天科 梁春年 秦文 裴杰 赵娟花 郭宪 阎萍
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 Ihh基因 多态性 高分辨率熔解曲线 生产性状 荧光定量 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 50-59
• 页数: 10页
• 分类号: S832.85|S813.3
• 字数: 5922字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.01.007

摘要

为了研究牦牛Ihh基因多态位点基因型组合与生产性状间的相关性,发现与牦牛生产性状相关的分子标记,同时进一步研究Ihh基因在牦牛和黄牛各个组织的分布和表达,试验采用高分辨率熔解曲线分析技术(Highresolution melting curve,HRM)进行基因型分型和统计等位基因频率,同时,运用荧光定量PCR分析Ihh基因在牦牛和黄牛不同器官的表达差异.试验结果表明,Ihh基因在牦牛和黄牛的所有组织中均表达.然后采用SHEsis和PHASE软件对Ihh基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS17.0进行多态位点单倍型组合与生产性状关联性分析.结果检测到牦牛Ihh基因外显子3的2个多态位点5855(C/T)和6383(G/A).群体遗传学分析显示,2个多态位点均表现为高度多态(PIC＞0.25);x2检验表明,甘南牦牛和大通牦牛群体在两个突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05),而天祝牦牛在2个突变位点处未达到Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05);多态位点配对连锁不平衡分析发现,2个突变位点之间存在强连锁平衡,有4种单倍型组合;基因型组合主要发现了3种.关联分析表明,Ihh基因2个突变位点的3种基因型组合对牦牛体斜长、体高、胸围、管围和体重有显著差异(P＜0.05),具有CTGA基因型组合的牦牛个体在体斜长、体高、胸围、管围和体重方面显著高于CCGG和TTAA型(P＜0.05).因此,综上推断Ihh基因基因型组合与牦牛体斜长、体高、胸围、管围和体重存在相关性.