滇西亚种树鼩微卫星分子标记的筛选

• 作者: 仝品芬 代解杰 尹博文 张媛 李振宇 李晓飞 陈玲霞
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 滇西亚种树鼩 微卫星分子标记 STR扫描
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 36-41
• 页数: 6页
• 分类号: R-33
• 字数: 2045字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671.7856.2015.006.008

摘要

目的：筛选出适用于滇西亚种树鼩种群遗传质量控制的特异性微卫星分子标记。方法首先从树鼩全基因组序列中筛选出约700个微卫星位点，择优选出约100个位点设计引物，去除有不良因素的，最后保留33对和文献报道的13对引物对滇西亚种树鼩DNA进行 PCR扩增，根据琼脂糖电泳和聚丙烯酰胺电泳结果筛选保留，进行STR扫描再次筛选适于树鼩遗传检测的微卫星位点组合。结果筛选出树鼩微卫星位点22个，STR基因扫描有明显Stutter峰。比较备选位点和最终筛选出的位点，普通树鼩位点中选取5个，2个可用，与滇西亚种的重合率是40％；印度小树鼩位点中选取5个，2个可用，重合率是40％；中缅树鼩的位点中选取3个，2个可用，重合率约70％。结论筛选出的22个微卫星位点适用于滇西亚种树鼩的遗传检测，为树鼩种群的遗传质量监测提供科学依据。