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4株猪流行性腹泻病毒S蛋白序列特征和遗传进化分析
4株猪流行性腹泻病毒S蛋白序列特征和遗传进化分析
作者:
吴华伟
夏业才
方超
李嘉琛
蔡青秀
邓永
郎洪武
陈晓春
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
猪流行性腹泻病毒
结构基因S
序列特征
遗传进化分析
摘要:
为了解目前国内猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗毒株的S蛋白差异情况,从2013年采自北京、河南、陕西、广东四个省市的疑似猪流行性腹泻病料中抽提RNA,用设计的针对结构基因S的特异性引物进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化情况和抗原位点进行分析.结果显示:4个样品株的S基因(4161 bp)与国内疫苗株CV777 (4152 bp)相比,存在15个核苷酸的插入和6个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在5个氨基酸的插入(59 QGVN62 and 140N)和2个氨基酸的缺失(163 NI164),且在主要突变区S1区的2个中和表位(499~638aa和764~771aa)有7处氨基酸突变.遗传进化分析结果显示,4个样品株与主要疫苗株同源性较低(93.8% ~94.7%),而与2007 ~2009年韩国毒株、2011年日本毒株以及中国近年流行毒株同源性高(96.0%~99.6%),表明近年来国内猪流行性腹泻病毒呈现较大变异,可能需要研制更有效的疫苗用于猪流行性腹泻的防控.
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猪流行性腹泻病毒
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文献信息
篇名
4株猪流行性腹泻病毒S蛋白序列特征和遗传进化分析
来源期刊
中国兽药杂志
学科
农学
关键词
猪流行性腹泻病毒
结构基因S
序列特征
遗传进化分析
年,卷(期)
2015,(7)
所属期刊栏目
微生物与免疫
研究方向
页码范围
1-7
页数
7页
分类号
S858.28
字数
3778字
语种
中文
DOI
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作者信息
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邓永
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猪流行性腹泻病毒
结构基因S
序列特征
遗传进化分析
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期刊影响力
中国兽药杂志
主办单位:
中国兽医药品监察所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-1280
CN:
11-2820/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街8号
邮发代号:
2-924
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
4331
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