γ-氨基丁酸受体基因的系统性调控网络

• 作者: 何露 李中 赵云燕 陈丹妮 雷清锋 韦睿
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 医学
• 关键词: 分子生物学 γ-氨基丁酸受体 开放性染色体 转录调控 转录因子 核膜血影重复蛋白
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 【生物工程】
• 页码范围: 128-136
• 页数: 9页
• 分类号: R338.2|Q426
• 字数: 6458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1249.2015.02128

摘要

提出一种多学科交叉结合的策略,试图初步获得系统性调控γ-氨基丁酸( gamma-aminobutyric acid, GABA)受体基因的转录因子线索。利用基于功能基因组学方法的DNA元件百科全书计划已发表的数据,系统性地获得GABA受体基因的开放染色质序列,并以此作为固相化探针,捕获与其特异性相互作用的蛋白质分子,并利用质谱分析鉴定蛋白。结果发现,对不同脑区获得的核蛋白,探针都能捕获到同样的特异性条带,然而,作为对照的天门冬氨酸( N-methyl-D-aspartate, NMDA)受体基因相关的开放染色质探针,在不同脑区中并未检获上述特异信号,说明结合蛋白是特异的。质谱分析表明,与GABA受体基因相关的开放染色质特异相互作用的蛋白是核膜血影重复蛋白-1( nuclear envelop spectrin repeatprotein-1, Nesprin-1),又称synaptic nuclear envelope-1(SYNE-1)。进一步的调控网络生物信息学分析表明, Nesprin-1可能与MAFA、 IRX2、 BCL6、 CEBPA 以及 RP58等转录因子形成复合物,并与 GABA 受体基因 GABRA5、GABRA6、 GABBR1和GABBR2等共表达。表明GABA受体基因在不同脑区是通过相同的转录调控机制进行表达的, Nesprin-1可能与 MAFA、 IRX2、 BCL6、 CEBPA 以及 RP58等转录因子形成复合物进而调控GABA受体基因表达,该特异的转录因子调控网络有望用于诱导多能干细胞或是前体细胞直接分化为GABA能神经元。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李中	中山大学附属第六医院神经科	22	177	7.0	13.0
2	何露	中山大学附属第六医院神经科	3	15	2.0	3.0
3	韦睿	中山大学附属第六医院神经科	3	15	2.0	3.0
4	雷清锋	中山大学附属第六医院神经科	6	27	3.0	5.0
5	赵云燕	中山大学附属第六医院神经科	2	11	1.0	2.0
6	陈丹妮	深圳大学光电工程学院	8	98	5.0	8.0