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摘要:
糖基化修饰对于维持植物小分子化合物的多样性具有重要的作用.糖基转移酶是催化该反应发生的主体,但其底物受体和供体特异识别机制仍未清楚.本研究从黑莓(Rubus spp.)材料中获得了一个糖基转移酶全长编码基因,并提交国际糖基转移酶命名委员会命名为UGT78H2(GenBank登录号:KM061379).该基因编码区全长1 380 bp,共编码459个氨基酸.编码蛋白的预测分子量为50.6 kD,等电点为5.88.生物信息学分析表明该酶具有植物糖基转移酶超家族Ⅰ成员具有的植物次生代谢产物糖基转移酶保守区;系统发育树分析,UGT78H2属拟南芥糖基转移酶F类群,可能参与类黄酮化合物糖基化.氨基酸水平与月季RhUF3GT1(UGT78H1)最相似,一致性为88%.UGT78H2在黑莓幼果期表达量最高,随着果实成熟,表达量迅速下降.以蒺藜苜蓿UGT78G1(PDB:3HBF)蛋白晶体结构为模板,同源模建了UGT78H2的结构,以其鉴定的受体催化活性中心与常见的11种类黄酮小分子进行分子对接.结果表明,UGT78H2最有可能催化的三种类黄酮化合物依次为黄酮醇槲皮素,柚皮素和黄烷醇表儿茶素.
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文献信息
篇名 黑莓糖基转移酶基因UGT78H2的分离鉴定及与类黄酮化合物的分子对接
来源期刊 植物研究 学科 农学
关键词 黑莓 UGT78H2 克隆 类黄酮 分子对接
年,卷(期) 2015,(2) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 270-278
页数 9页 分类号 S663.2
字数 语种 中文
DOI 10.7525/j.issn.1673-5102.2015.02.015
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 汤浩茹 150 2302 23.0 42.0
2 王小蓉 51 624 16.0 23.0
3 陈清 45 318 9.0 17.0
4 张云婷 11 59 4.0 7.0
5 王燕 34 103 5.0 9.0
6 江雷雨 13 22 2.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
黑莓
UGT78H2
克隆
类黄酮
分子对接
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物研究
双月刊
1673-5102
23-1480/S
大16开
哈尔滨市和兴路26号东北林业大学
14-77
1959
chi
出版文献量(篇)
2736
总下载数(次)
1
总被引数(次)
29792
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导