人肝内胆管癌细胞株RBE的基因表达

• 作者: 徐菁 李灵敏 王婕 覃艳红 贺杰峰 贺艳玲 陈秀花
• 来源期刊: 中华肝胆外科杂志
• 关键词: 肝内胆管癌 肝脏干/祖细胞 基因芯片 信号通路
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 373-376
• 页数: 4页
• 字数: 2541字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-8118.2015.06.004

摘要

目的 通过比较肝内胆管细胞癌RBE细胞株中NCAM+ c-Kit+与NCAM-c-Kit-的全基因组表达差异,筛选出与干细胞信号通路相关的差异基因,进一步揭示肝内胆管癌发生、发展的内在分子机制.方法 培养RBE细胞株,用免疫磁珠分选出NCAM+ c-Kit+ RBE与NCAM-c-Kit-RBE亚群,采用Agilent人全基因组表达谱芯片对NCAM+ c-Kit+ RBE与NCAM-c-Kit-RBE进行检测.通过SAS系统分析,得到两者干细胞信号通路的差异表达基因,进一步采用实时-PCR技术验证芯片结果.结果 芯片筛选出NCAM+ c-Kit+ RBE与NCAM-c-Kit-RBE亚群之间的差异基因共7270条[变化倍数(fc)≥2或fc≤0.5].与NCAM-c-Kit-RBE相比,NCAM+ c-Kit+ RBE上调基因3572条,下调基因3698条.其中干细胞信号通路相关差异基因共421条(fc≥2或fc≤0.5),上调基因231条,下调基因190条.结论 高通量芯片能够筛选出NCAM+ c-Kit+ RBE与NCAM-c-Kit-RBE大量的差异基因.SAS分析系统能进一步分析与干细胞信号通路相关的差异基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	覃艳红	山西医科大学第二医院血液病研究所	32	68	5.0	5.0
2	陈秀花	山西医科大学第二医院血液病研究所	23	41	4.0	4.0
3	徐菁	山西医科大学病理教研室	38	109	6.0	8.0
4	李灵敏	山西医科大学病理教研室	58	206	8.0	11.0
5	王婕	山西医科大学病理教研室	11	16	3.0	4.0
6	贺艳玲	连云港市第一人民医院病理科	4	3	1.0	1.0
7	贺杰峰	山西大医院普外科	2	4	1.0	2.0