玉米叶序对生候选基因筛选及克隆

• 作者: 李猛 束苏波 谈应权 马庆
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 对生叶序 差异基因 候选基因 克隆
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 作物学
• 页码范围: 333-340
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20150424.016

摘要

根据近等基因系对生叶序玉米H4D与互生叶序玉米H4d的转录组测序数据筛选出的差异基因,结合玉米对生基因OPP-1和OPP-2的SSR分子标记定位,将19个玉米对生叶序差异基因进行了染色体定位.利用比较基因组学和生物信息学分析对染色体定位的差异基因进行了详细分析,发现11个对生叶序差异基因具有同源基因报道,对其进行荧光定量PCR验证后发现基因表达量变化与转录组数据较为一致,其中8个基因在对生中表达量显著提高,3个基因在对生中表达量下降.结合差异基因染色体定位与同源性分析,筛选确定了SSR标记定位之间的5个差异基因作为候选基因.启动子分析表明这些基因启动子区域发现了多个与激素和光信号诱导相关的作用元件.以对生玉米近等基因系H4D和H4d的四叶期茎尖生长点cDNA为模板,对候选基因进行克隆,成功克隆出GRMZM2G077744_T01,GRMZM2G064845 T01和GRMZM2G348959 T01基因.经测序和氨基酸序列比对,发现在H4D和H4d中,GRMZM2G077744_T01基因氨基酸序列同源性为97.30％,GRMZM2G064845 T01同源性为98.85％,GRMZM2G348959_T01同源性为98.50％.氨基酸序列上的差异可能与玉米叶序对生变异具有密切关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李猛		30	154	6.0	11.0
2	谈应权	安徽农业大学生命科学学院	20	90	6.0	9.0
3	马庆	安徽农业大学生命科学学院	25	122	6.0	10.0
4	束苏波	安徽农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0