烟酰胺酶催化水解脱氨反应的QM/MM分子动力学模拟

• 作者: 张欣 段新丽 雷鸣
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 烟酰胺酶 脱氨 反应机理 QM/MM方法 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 物理化学
• 页码范围: 2491-2496
• 页数: 6页
• 分类号: O641
• 字数: 2840字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20150365

摘要

采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻过程并降低整个催化反应的能垒.讨论了氨分子的离去过程和质子传递过程的相关细节.为烟酰胺酶的定点突变以及脱氨酶的设计提供了有益的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段新丽		1	0	0.0	0.0
2	张欣		1	0	0.0	0.0
3	雷鸣		1	0	0.0	0.0