‘砀山酥梨’果实CCoAOMT基因的克隆与表达分析

• 作者: Khanizadeh Shahrokh 孙炜 张绍铃 王丹阳 芮伟康 陶书田 高付永
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 砀山酥梨 CCoAOMT基因 基因克隆 生物信息学分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 33-40
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2015.01.006

摘要

[目的]通过克隆‘砀山酥梨’(Pyrus bretschneideri‘Dangshansuli’)果实中咖啡酰-辅酶AO-甲基转移酶(CCoAOMT)基因的全长序列,并对其进行生物信息学及基因表达差异分析,阐释了其在梨果实木质素合成途径的作用,以期为今后利用基因调控技术来改变果实中石细胞含量从而改善梨果实品质提供一定的理论依据.[方法]以15年生‘砀山酥梨,果实为试材,根据从NCBI数据库中搜索得到关于植物木质化的CCoAOMT基因序列与梨基因组数据库调取的序列比对,利用RT-PCR技术克隆得到了木质素生物合成途径中的一种关键酶基因PbCCoAOMT,GenBank登录号为KJ577544.[结果]该基因全长1 133 bp,具有1个744 bp的完整开放阅读框(ORF),编码247个氨基酸.序列比对及系统进化树分析表明:CCoAOMT酶是氧甲基转移酶类,与其他植物CCoAOMT编码的蛋白序列有较高的相似性,尤其与枇杷的相似度最高,达到98.79％,且亲缘关系最近.利用荧光定量PCR技术对其在果实不同发育时期表达模式的分析发现,基因表达量呈先上升后下降的趋势,与梨果实中石细胞含量的变化趋势相似.[结论]初步认为从‘砀山酥梨,中克隆得到的PbCCoAOMT基因可能参与了梨果实中木质素的代谢.