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焦磷酸测序试剂盒检测HBV耐药的性能评价及临床适用性
焦磷酸测序试剂盒检测HBV耐药的性能评价及临床适用性
作者:
刘颖
周彬
孙剑
申笙
郑志丹
陈华
陈简
隋少飞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝炎病毒,乙型
耐药
焦磷酸测序
Sanger测序
摘要:
目的 评价焦磷酸测序试剂盒(HBV DRT)检测HBV耐药的性能及临床适用性.方法 使用HBV核酸定量标准品梯度稀释系列样品验证试剂盒PCR检测下限;使用含HBV基因序列rt区片段、10个耐药相关突变位点均为野生型或均为突变型的2个质粒样品制备不同突变型/野生型比例的系列样品,重复检测至少10次用于评价试剂盒的准确性及建立突变比例真实值与检测值的线性关系;选取102例经Sanger测序分析rt区序列的核苷(酸)类药物治疗慢性乙型肝炎患者临床样本,使用HBV DRT试剂盒检测分析10个HBV耐药相关突变位点的特征,评价两种测序分析结果的一致性.结果 HBV DRT的PCR检测下限为50 IU/ml;线性分析提示除rt236位点外,其他9个耐药位点的突变比例真实值与检测值线性关系均达到R2> 0.98(P<0.001);临床样本检测结果显示,4例样本部分位点PCR扩增失败,98例样本HBV DRT与Sanger测序检测结果比较,差异有统计学意义(x2=71.2,P<0.001),总符合率达92.6% (897/969),其中10个耐药相关突变位点结果全部一致的样本占46.9%(46/98).两种测序方法在10个位点上的一致率介于71.5%~ 100%;两种测序结果不一致中,87.5% (63/72)为Sanger测序结果为野生型(WT)而HBV DRT检测结果为WT/突变混合型(MT),6.9% (5/72)为Sanger测序结果为WT而HBV DRT检测结果为MT,5.6% (4/72)为Sanger测序结果为WT/MT而HBVDRT检测结果为WT.结论 HBV DRT试剂盒检测乙型肝炎耐药基因具有良好的敏感性和准确性,在检测样本中存在少量病毒突变株时优于直接测序,可用于耐药突变的早期检测.
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文献信息
篇名
焦磷酸测序试剂盒检测HBV耐药的性能评价及临床适用性
来源期刊
中华肝脏病杂志
学科
关键词
肝炎病毒,乙型
耐药
焦磷酸测序
Sanger测序
年,卷(期)
2015,(6)
所属期刊栏目
病毒性肝炎
研究方向
页码范围
422-427
页数
6页
分类号
字数
4327字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2015.06.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘颖
南方医科大学南方医院肝病中心和感染内科
18
63
4.0
7.0
2
周彬
南方医科大学南方医院肝病中心和感染内科
33
126
6.0
9.0
3
陈简
南方医科大学南方医院肝病中心和感染内科
1
0
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4
郑志丹
南方医科大学南方医院肝病中心和感染内科
1
0
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申笙
南方医科大学南方医院肝病中心和感染内科
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隋少飞
1
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陈华
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研究主题发展历程
节点文献
肝炎病毒,乙型
耐药
焦磷酸测序
Sanger测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华肝脏病杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-3418
CN:
50-1113/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市南岸区天文大道288号重庆医科大学附属第二医院江南院区感染与肝病中心
邮发代号:
78-56
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
6380
总下载数(次)
6
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