甘蓝型油菜分枝数QTL定位及其候选基因预测

• 作者: 于景印 刘胜毅 刘越英 张凤启 程晓辉 童超波 董彩华 黄军艳
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 SNP标记 分枝数 QTL定位 油菜60K SNP芯片
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 15-20
• 页数: 6页
• 分类号: S565.403
• 字数: 4243字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2015.01.003

摘要

分枝数是影响油菜产量的重要株型性状之一.为了有助于油菜分枝数的分子标记辅助育种,以甘蓝型油菜品系888-5(多分枝)和M083(少分枝)杂交形成的重组自交系(RIL)群体为材料,通过利用第一张油菜60KSNP芯片对群体进行高通量SNP分型,并结合单环境和多环境2种QTL检测方法对RIL群体在4个环境(武汉-2012、武汉-2013、扬州-2012和扬州-2013)下分枝数进行QTL定位.结果表明:共检测出18个分枝数QTL,分布于A2、A6、A7、C1和C4连锁群.其中11个QTL在2个以上环境下可重复检测到;有2个QTL与环境之间存在互作效应.主效QTL 2个(qBN2-3和qBNE2-1),分别在3个、4个环境下重复检测到,可解释的表型变异为13.12％～20.60％,2.80％ ～30.10％.qBNE2-1与环境存在互作效应.另外,通过利用SNP标记侧翼序列和油菜基因组比对作图,从3个QTL(qBN2-1、qBN7-6和qBN7-8,三者可解释的表型变异分别为19.40％～17.30％、5.70％～12.21％和7.88％～10.32％)的基因组区段内(分别为279kb、165kb和562kb)共筛选出4个与分枝数有关的候选基因,它们的拟南芥同源基因(分别为CUC2、PIN3、F23N20.8和PIN4)均参与拟南芥分枝数的分化或形态建成.